Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC106Q9BWC9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms