Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTDSS2Q9BVG9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTDSS2Q9BVG9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms