Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SLC39A3Q9BRY0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A3Q9BRY0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms