Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms