Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCLRE1CQ96SD1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms