Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms