Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STAMBPL1Q96FJ0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STAMBPL1Q96FJ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms