Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFT1Q96AA3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RFT1Q96AA3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms