Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRUQ92729 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRUQ92729 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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PTPRUQ92729 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRUQ92729 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRUQ92729 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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PTPRUQ92729 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRUQ92729 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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