Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APCDD1LQ8NCL9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APCDD1LQ8NCL9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms