Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms