Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms