Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGD3Q5JSP0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms