Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms