Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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