Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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