Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CTF1Q16619 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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