Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F4Q16254 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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