Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK4Q16099 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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GRIK4Q16099 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK4Q16099 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms