Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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