Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEBPEQ15744 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms