Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKIV2LQ15477 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKIV2LQ15477 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms