Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB39AQ14964 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms