Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NCOA4Q13772 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCOA4Q13772 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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