Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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