Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms