Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POLEQ07864 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
POLEQ07864 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
POLEQ07864 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POLEQ07864 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms