Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms