Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSG4Q00888 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSG4Q00888 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSG4Q00888 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSG4Q00888 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSG4Q00888 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSG4Q00888 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSG4Q00888 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSG4Q00888 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms