Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN10P78369 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms