Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBB4BP68371 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms