Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1P60507 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms