Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA9P57773 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA9P57773 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA9P57773 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA9P57773 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA9P57773 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GJA9P57773 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GJA9P57773 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GJA9P57773 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA9P57773 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GJA9P57773 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms