Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EEFSECP57772 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms