Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms