Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMAN1P49257 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms