Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSNK1A1P48729 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms