Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms