Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SFNP31947 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SFNP31947 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFNP31947 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFNP31947 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFNP31947 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFNP31947 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFNP31947 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFNP31947 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms