Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX2P28328 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX2P28328 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms