Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSFA2P28290 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms