Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA6P23229 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA6P23229 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms