Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXA5P20719 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms