Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms