Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTPS1P17812 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms