Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CREB1P16220 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CREB1P16220 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms