Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms