Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRF1P14222 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms