Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ODC1P11926 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ODC1P11926 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODC1P11926 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms