Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPBP07199 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPBP07199 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPBP07199 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPBP07199 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPBP07199 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms